Озеро ежегодно замерзает в конце ноября, лед имеет толщину до 1,4 м, по льду прокладывается автомобильный зимник. Обычно он не отмечен вешками (так было только однажды — в 2004 году). Основной зимник проходит под восточным берегом. Так же, как и на Байкале, препятствием для автомобилей становятся становые трещины, образующиеся ежегодно поперек озера между мысами, и глубокий снег в наметах. Особенно много становых трещин возникает в центре озера у островов Далайн-Модон-Хуйс и Цамо-Хад. Трещины идут поперек озера от берега до берега. Больших непроходимых торосистых участков льда обычно на Хубсугуле не бывает, однако подъехать, например, по льду к самому большому острову Далайн-Модон-Хуйс часто из-за торосов и неровно смерзшегося битого льда трудно. Гладкий отполированный лед встречается на юге озера вблизи Хатгала. Большая часть льда на озере за зиму закрывается снегом, причем его глубина больше у восточного берега. Лед бывает волнистым, по нему трудно ехать, поэтому путешествия по глубокому снегу на льду на велосипедах или коньках — экстремальное приключение. Из-за восходящих газов и ключей вблизи Хатгала в месте истока Эгийн-Гола опасным местом является лед западнее острова Цамо-Хад. Во время работы нефтебазы в Ханхе, когда по льду перевозили топливо в бензовозах, около 40 грузовиков провалились. После этого перевозки по льду тяжелых грузов были запрещены.

По сравнению с Байкалом на льду Хубсугула снега и трещин меньше, но бывают на удивление мощные надвиги льда у западного берега. Их высота достигает 5 метров, трещина с высокими торосами тянется практически вдоль всего западного берега от Той-логта до полуострова До-лон. Восточный берег из-за преимущественно сильных западных ветров при замерзании озера отличается великолепием наплескового льда, местами покрывающего скалы на высоту до 10-12 метров. Красота и прозрачность не уступает знаменитым зимним наплескам на байкальских мысах, только на Хубсугуле протяженность скалистого берега с наплесками больше и их белоснежность сохраняется дольше — до апреля. Стволы близко растущих к кромке воды лиственниц при осенних штормах на несколько метров одеваются в ледовую корку, что придает неповторимый колорит зимнему побережью.

Хубсугульский лед благоприятен для путешествий на внедорожниках или конных упряжках. По замерзшим заболоченным долинам до середины апреля на автомобиле можно попасть в удаленные места, труд-ноступные для проезда на лошадях в другое время. Вскрытие озера происходит в мае, лед в северной части озера плавает до начала июня, а льдины, выдвинутые на берег, не тают до конца первой декады июня